在首部曲《魔戒远征队》中，记述了灰袍甘道夫发现哈比人佛罗多所拥有的戒指，其实正是至尊魔戒，统御所有权能之戒的魔戒之王。因此，佛罗多和伙伴们从夏尔一路被魔多的黑骑士追杀，最后，在伊利雅德的游侠亚拉冈的帮助下，他们终于克服万难，逃到了瑞文戴尔的爱隆居所。
爱隆在该处慎重地举行了一场会议，决定将魔戒摧毁，佛罗多也被指派为魔戒持有者。魔戒远征队的成员就这样被挑选出来，他们的任务是前往魔王之境的末日火山，在该处摧毁魔戒。远征队中包括了代表人类的亚拉冈和刚铎之王继承人波罗莫；幽暗密林的精灵国王之子勒苟拉斯代表精灵，孤山山脉的葛罗音之子金雳代表矮人；佛罗多和他的仆人山姆卫斯，以及两名年轻的亲戚梅里雅达克和皮聘则代表哈比人，而率领全体的是灰袍甘道夫。一行人秘密地从瑞文戴尔离开，在经过长途跋涉之后，却因意图在冬天横越卡拉霍拉斯隘口而无法通过该处；之后，甘道夫带领他们从密道进入摩瑞亚矿坑，试图从山底下前往目的地。甘道夫在该处由于和一名黑暗世界的妖灵搏斗，因此落入了无底深渊。被揭穿了西方王储身分的亚拉冈继承遗志，带领着众人逃出摩瑞亚的东门，进入精灵的疆界罗瑞安，并且沿着大河而下，来到拉洛斯瀑布。他们在这段旅程中已经意识到遭人跟踪，对魔戒念念不忘的生物咕鲁，锲而不舍地紧追在后。
他们必须决定是否该往东前往魔多，或者是和波罗莫一起前往援助刚铎的主城米那斯提力斯，面对即将到来的大战，还是应该解散小队。当魔戒持有者决定必须继续前往魔多的旅程时，绝望的波罗莫试图抢夺魔戒。故事的首部曲就在波罗莫屈服于诱惑，佛罗多逃出虎口，和山姆卫斯一起消失的状况下结束了。在此同时，剩余的远征队成员遭到半兽人士兵突如其来的攻击，有些是听命于黑暗魔君的半兽人，有些则是来自叛徒萨鲁曼旗下的半兽人。魔戒持有者的任务，似乎已经遭遇到空前未有的危机。
二部曲《双城奇谋》描述的是远征队解散之后的状况。上半部分（第一节到第十一节）中记述了波罗莫的悔悟和牺牲，众人将他的尸体放入船中，漂向拉洛斯瀑布。梅里雅达克和皮瑞格林则是被半兽人士兵俘虏，敌人沿着东洛汗平原将他们带往艾辛格，亚拉冈、勒苟拉斯和金雳则是紧追在后。
此时，洛汗国的骠骑出现了，在元帅伊欧墨的率领之下，骑兵队在法贡森林的边境包围了半兽人，并且将他们彻底歼灭。哈比人即时逃出，躲进森林中，并且遇见了名为树胡的树人，他也是法贡森林真正的主人。在他的陪伴下，哈比人见识到了树人的怒气，以及他们朝向艾辛格进军的过程。
在此同时，亚拉冈和同伴们遇见了刚离开战场的伊欧墨，骠骑元帅送给他们骏马，让他们继续寻找同伴。虽然亚拉冈一行人在法贡森林中没有找到哈比人，却意外地和甘道夫重聚。他从死里复生，化身成白骑士，却依旧穿着灰色的袍子。他们和老巫师一起穿越洛汗，来到了骠骑王希优顿的宫殿。甘道夫治愈了年老的国王，并且将他从弄臣巧言的诅咒中释放出来，众人这才明了巧言原来是萨鲁曼所安排的内奸。一行人和御驾亲征的国王一起迎战艾辛格的大军，在圣盔谷以寡击众，获得了胜利。甘道夫接着带领众人前往艾辛格，他们发现原先雄伟的堡垒已经被树人彻底破坏，萨鲁曼和巧言则是被困在坚固不破的欧散克塔中。
在谈判过程中，萨鲁曼拒绝悔改，甘道夫撤销了他的头衔、打断了他的手杖，把他交给树人看管。巧言从窗户中对着甘道夫丢出一枚水晶球，却没有砸中，反而被皮聘所捡起。这原来是努曼诺尔残存的三枚真知晶球之一。当天夜里，皮聘抵抗不了晶球的诱惑，偷走晶球，并且加以使用；索伦也因此而发现了他的行踪。在这章尾声中，一名戒灵骑在飞行的座骑上，让众人明了到大战即将展开。甘道夫把真知晶球交给亚拉冈，和皮瑞格林快马加鞭地赶往米那斯提力斯。
下半部分（第十二节开始）的主人翁则是佛罗多和山姆卫斯，他们迷失在爱明莫尔的山区，不知何去何从。当他们终于脱离山区的时候，狡诈的咕鲁却又尾随而至。佛罗多驯服了咕鲁，让他带领着两人穿越死亡沼泽，以及寸草不生的摩拉南，来到了北方魔多的黑色大门前。
由于此时已经无路可走，佛罗多只好接受咕鲁的建议：前往他所知道的一条“秘密通道”。据他说，这条通道就在黯影山脉中，亦即是魔多的西方屏障。在他们旅行的途中，又被波罗莫的弟弟法拉墨所率领的刚铎突击队所掳获。法拉墨发现了他们此行的真正目的，但却谨慎自制，不受让波罗莫崩溃的魔力所诱惑，反而派人护送他们前往旅程的最后一段，西力斯昂哥，也就是蜘蛛小径。他也警告佛罗多，这是个危险的地方，咕鲁并没有完全吐实。当他们抵达十字路口，朝向米那斯魔窟前进的时候，却发现一股无比强大的黑暗力量从城中倾巢而出。索伦已经派出了他的先头部队，由戒灵之王所率领的大军，吹响了魔戒圣战的号角。
咕鲁领着哈比人走上一条避开米那斯魔窟的秘道，在黑暗中他们终于来到了西力斯昂哥。咕鲁又再度恢复了之前的邪恶本性，准备将他们献给这条小径的邪恶守护者尸罗。在山姆卫斯奋不顾身的搏斗下，他的计划失败了；咕鲁被打伤，尸罗也被重创。
二部曲结束于山姆卫斯所面临的两难状况中。佛罗多被尸罗刺中，看来毫无生机地躺在地上：山姆卫斯如果不舍弃敬爱的主人，这次任务就将一败涂地。最后，他决定取走魔戒，继续这绝望的任务。但正当他准备进入魔多时，半兽人分别从米那斯魔窟和西力斯昂哥的高塔前来察看。山姆卫斯藉着魔戒隐形的力量，这才知道佛罗多只是陷入昏迷，并非死亡。当他准备救回主人时，一切已经太迟了；半兽人已经将佛罗多抱入隧道，前往他们的高塔中，大门正好在山姆卫斯面前重重关上。
本书，也就是第三部分，魔戒圣战的最后一部分，将描述甘道夫和索伦对抗的战略，记载了光明与黑暗双方的冲突，以及黑暗时代的终结。首先，让我们来看看西方大战的结果如何——